生物多样性是检验自然生态环境好坏的一个重要指标。近年来，盐都区不断加大湿地保护和修复力度，大力实施湖区生物多样性保护，切实改善区域生态环境质量，建设人与自然和谐共生的美丽环境。

位于盐都区的盐城大纵湖国家湿地公园，由大纵湖及周边湿地组成，公园内自然景观独特，生态系统结构完整，植被多样，物种丰富，以得天独厚的自然环境吸引着游客前来参观游玩，园内各类花草树木错落有致、生机盎然，空气中弥漫着淡淡的清香。乘船进入芦荡迷宫，耳边不时传来鸟儿欢快的叫声，湖面上三五成群的水鸟在这里嬉水、栖息，人与自然和谐共生的动人场景随处可见。

近年来，盐城大纵湖旅游度假区实施了引江入湖、退渔还湖、生态修复、蟒蛇河口疏浚拓宽等四大工程，积极探索“以渔控藻净水”路子，大力推广“以渔养水、以渔净水”养殖理念，通过适度放流来改善水质和水域的生态环境，发挥鱼蟹的净水生态功能，保护生物多样性，生态环境得到显著改善。湖区水体可达Ⅱ类标准，水生植被覆盖率达40%，湿地生物多样性明显增加，湖中螺鱼虾蟹类资源丰富，珍稀动植物种类达378种，生态系统得到极大改善，冬季再现“百万水鸟飞平湖”的壮观景象。